VASP參數(shù)設(shè)置詳解.doc
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VASP參數(shù)設(shè)置詳解軟件主要功能: 采用周期性邊界條件(或超原胞模型)處理原子、分子、團簇、納米線(或管)、薄膜、晶體、準(zhǔn)晶和無定性材料,以及表面體系和固體 l 計算材料的結(jié)構(gòu)參數(shù)(鍵長、鍵角、晶格常數(shù)、原子位置等)和構(gòu)型 l 計算材料的狀態(tài)方程和力學(xué)性質(zhì)(體彈性模量和彈性常數(shù)) l 計算材料的電子結(jié)構(gòu)(能級、電荷密度分布、能帶、電子態(tài)密度和ELF) l 計算材料的光學(xué)性質(zhì) l 計算材料的磁學(xué)性質(zhì) l 計算材料的晶格動力學(xué)性質(zhì)(聲子譜等) l 表面體系的模擬(重構(gòu)、表面態(tài)和STM模擬) l 從頭分子動力學(xué)模擬 l 計算材料的激發(fā)態(tài)(GW準(zhǔn)粒子修正) 計算主要的四個參數(shù)文件:INCAR ,POSCAR,POTCAR ,KPOINTS,下面簡要介紹,詳細(xì)權(quán)威的請參照手冊 INCAR文件: 該文件控制VASP進(jìn)行何種性質(zhì)的計算,并設(shè)置了計算方法中一些重要的參數(shù),這些參數(shù)主要包括以下幾類: l 對所計算的體系進(jìn)行注釋:SYSTEM l 定義如何輸入或構(gòu)造初始的電荷密度和波函數(shù):ISTART,ICHARG,INIWAV l 定義電子的優(yōu)化 – 平面波切斷動能和綴加電荷時的切斷值:ENCUT,ENAUG – 電子部分優(yōu)化的方法:ALGO,IALGO,LDIAG – 電荷密度混合的方法:IMIX,AMIX,AMIN,BMIX,AMIX_MAG,BMIX_MAG,WC,INIMIX,MIXPRE,MAXMIX – 自洽迭代步數(shù)和收斂標(biāo)準(zhǔn):NELM,NELMIN,NELMDL,EDIFF l 定義離子或原子的優(yōu)化 – 原子位置優(yōu)化的方法、移動的步長和步數(shù):IBRION,NFREE,POTIM,NSW – 分子動力學(xué)相關(guān)參數(shù):SMASS,TEBEG,TEEND,POMASS,NBLOCK,KBLOCK,PSTRESS – 離子弛豫收斂標(biāo)準(zhǔn):EDIFFG l 定義態(tài)密度積分的方法和參數(shù) – smearing方法和參數(shù):ISMEAR,SIGMA – 計算態(tài)密度時能量范圍和點數(shù):EMIN,EMAX,NEDOS – 計算分波態(tài)密度的參數(shù):RWIGS,LORBIT l 其它 – 計算精度控制:PREC – 磁性計算:ISPIN,MAGMOM,NUPDOWN – 交換關(guān)聯(lián)函數(shù):GGA,VOSKOWN – 計算ELF和總的局域勢:LELF,LVTOT – 結(jié)構(gòu)優(yōu)化參數(shù):ISIF – 等等。 主要參數(shù)說明如下: ? SYSTEM:該輸入文件所要執(zhí)行的任務(wù)的名字。取值:字符串,缺省值:SYSTEM ? NWRITE:輸出內(nèi)容詳細(xì)程度。取值:0~4,缺省值:2 如果是做長時間動力學(xué)計算的話,最好選0或1(首末步/每步核運動輸出),短時運算用2,選3則會在出錯的時候給出說明信息。 ? ISTART:決定是否讀取WAVECAR文件。取值:0~2,缺省0/1 for無/有前次計算的WAVECAR(波函數(shù)) 0:begin from scratch,根據(jù)INIWAV初始化波函數(shù) 1:restart with constant energy cut-off,從WAVECAR讀取波函數(shù)(重定義平面波集) 2:restart with constant basis set,從WAVECAR讀取波函數(shù)(平面波集不變) ? ICHARG:決定如何建立初始電荷密度。取值:0~2,缺省值: if ISTART=0 2 else 0 0:由初始波函數(shù)計算電荷密度 1:從CHGCAR文件讀取電荷密度 2:使用原子電荷密度的疊加 +10非自洽計算 ? ISPIN:是否進(jìn)行spin polarized calculation。取值:1,2(1-no,2-yes),缺省值:2 ? MAGMOM:在ICHARG=2或在CHGCAR中未包含磁化密度(ICHARG=1)時,指定每個原子的初始磁化時刻。取值:實數(shù)數(shù)組,缺省值:對ISPIN=2 NIONS*1.0,對非共線型磁化體系3*NIONS*1.0 ? INIWAV如何設(shè)置初始波函數(shù),只在ISTART=0時使用。取值:0,1(0-最低動能的平面波,1-隨機數(shù)),缺省值:1。 ? IDIPOL控制計算單極、偶極和四極修正。取值:1~4。 1~3只計算第一/二/三晶矢方向,適于厚板(slab)的計算 4 所有方向都計算,適于計算孤立分子 ? PREC進(jìn)動(precession)。取值:low/medium/high/normal/ accurate/single),缺省值: Normal(VASP.4.X);Medium(VASP.5.X) VASP4.5+采用了優(yōu)化的accurate來替代high,所以一般不推薦使用high。不過high可以確?!敖^對收斂”,作為參考值有時也是必要的。同樣受推薦的是normal,適于作為日常計算選項。 受PREC影響的參數(shù)有四類:ENCUT;NGX,NGY,NGZ;NGXF,NGYF,NGZF;ROPT。如果設(shè)置了PREC,這些參數(shù)就都不需要出現(xiàn)了,當(dāng)然直接設(shè)置相應(yīng)的參數(shù)也有同樣效果。具體影響效果見p53~54。 ? ENCUT平面波基組的截斷能量(eV)。取值:實數(shù),缺省值:受PREC設(shè)置影響,從POTCAR文件中找出相應(yīng)的ENMAX/ENMIN值來設(shè)置。 PREC = Low Medium Accurate Normal ENCUT = ENMIN ENMAX ENMAX ENMAX Single High ENMAX ENMAX*1.3 對于多個元素不同的ENMAX/ENMIN,都取最大值。 該參數(shù)非常重要,最好不要手工去設(shè)置,除非文獻(xiàn)告訴你要用多少,或者經(jīng)過結(jié)果可靠性的驗證。當(dāng)然,為了測試一下提交的任務(wù),也不妨先設(shè)個較小的值。 ? NGX,NGY,NGZ:控制FFT網(wǎng)格在三個晶矢方向上的格點數(shù)量。 ? NGFX,NGFY,NGFZ:控制第二次更精確的FFT網(wǎng)格的格點數(shù)量。 也是兩類重要的最好不要去動的參數(shù)。在未指定的情況下將根據(jù)PREC的設(shè)置從POTCAR中自動讀取。 PREC=High/Accurate,基組中向量的2倍值,用來避免wrap around errors,得到精確解。 PREC=Low/Medium/Normal,基組中向量的3/4倍值(已足夠精確到 1 meV/atom)。 ? LREAL:決定投射是在實空間還是倒易空間進(jìn)行。取值:.TRUE.(實空間)/.FALSE.(倒易空間),缺省值:.FALSE. 用于求解贗勢的非局域部分用到的一個積分,在倒格空間里采用平面波基組求解,在實空間里則采用積分球求解。 其他還有兩個選項:O or On,A or Auto。 On和.TRUE.的差別在于是否使用King-Smith算法優(yōu)化,設(shè)為Auto則進(jìn)行自動選擇,推薦使用。 ? ROPT:在LREAL=Auto or On時,優(yōu)化控制每個核周圍的積分球內(nèi)的格點數(shù)。取值:實數(shù)數(shù)組 For LREAL=On PREC=Low, 700 points in the real space sphere (ROPT=0.67) PREC=Med, 1000 points in the real space sphere (ROPT=1.0) PREC=High, 1500 points in the real space sphere (ROPT=1.5) For LREAL=Auto PREC=Low, accuracy 10-2 (ROPT=0.01) PREC=Med, accuracy 2*10-3 (ROPT=0.002) PREC=High accuracy 2*10-4 (ROPT=2E-4) ? NELM, NELMIN and NELMDL:控制電子自洽循環(huán)步數(shù)。取值:整數(shù) NELM:電子自洽循環(huán)最大次數(shù)。缺省值:60 NELMIN:電子自洽循環(huán)最小次數(shù)。缺省值:2 NELMDL:弛豫次數(shù)。缺省值:if ISTART=0, INIWAV=1, and IALGO=8,-5,if ISTART=0, INIWAV=1, and IALGO=48,-12,else 0 NELMDL可以取負(fù)值。如果初始波函數(shù)采用隨機賦值,即ISTART=0,INIWAV=1,那么很可能開始的值比較離譜,那么在第一步核運動循環(huán)之前采用NELMDL(負(fù)值)步的非自洽(保留初始的H)步計算將減少計算所需的時間。 ? EDIFF:指定電子自洽循環(huán)的全局中斷條件,用于控制收斂精度。取值:實數(shù),缺省值:10-4 注意,即使EDIFF=0,NELM步電子自洽循環(huán)也會執(zhí)行。 ? EDIFFG:指定離子弛豫循環(huán)的中斷條件,用于控制核運動的收斂精度。取值,實數(shù),缺省值:10*EDIFF EDIFFG>0在兩個離子步的總自由能之差小于EDIFFG時停止 EDIFFG<0在所有的力都小于EDIFFG時停止。 EDIFFG=0在NSW步弛豫后停止 此參數(shù)不支持MD,僅用于弛豫。 ? NSW:給出最大離子步數(shù)。取值:整數(shù),缺省值:0。 ? NBLOCK,KBLOCK:取值:整數(shù),缺省值:NBLOCK = 1,KBLOCK = NSW 在NBLOCK離子步后對成對相關(guān)函數(shù)和DOS進(jìn)行計算,并且把離子配置寫入XDATCAR文件。 在KBLOCK*NBLOCK步主循環(huán)后平均的成對相關(guān)函數(shù)和DOS被寫入PCDAT和DOSCAR文件。 ? IBRION:決定離子怎樣更新和運動。取值:-1~3,5~8(-1-無更新,0-MD,1-RMM-DIIS,2-共軛梯度算法,3-Damped MD,5,6:有限差分,7,8:密度函數(shù)擾動理論),缺省值:if NSW=0/1,-1,else 0 這個參數(shù)是和ISIF, IALGO/ALGO一起決定怎么算的最重要的參數(shù)。 1~3是三種弛豫的方法,根據(jù)ISIF決定是否固定離子位置、晶胞大小和形狀,在INCAR中必須設(shè)置參數(shù)POTIM。 0是標(biāo)準(zhǔn)的ab-initio MD,不受ISIF影響,即不改變晶胞大小和形狀。 5~8支持Hessian Matrix和phonon frequency的計算以及部分固定的MD。 ? POTIM:IBRION=0時,給出MD每步步長(fs),IBRION=1~3時,給出最小化的度量常量。取值:實數(shù),缺省值:IBRION=0無缺省,必須指定,IBRION=1,2,3 0.5 ? ISIF:決定是否計算應(yīng)力張量以及弛豫中晶胞變化的自由度。取值:0~6,缺省值:if IBRION=0(MD) 0 else 2 ISIF│calculate│ calculate │ relax│ change │ change │ force │stress tensor│ ions │ cell shape│cell volume ----┼-------┼-----------┼------┼---------┼--------- 0│ yes │ no │ yes │ no │ no 1│ yes │ trace only │ yes │ no │ no 2 │ yes │ yes │ yes │ no │ no 3 │ yes │ yes │ yes │ yes │ yes 4 │ yes │ yes │ yes │ yes │ no 5 │ yes │ yes │ no │ yes │ no 6 │ yes │ yes │ no │ yes │ yes 7 │ yes │ yes │ no │ no │ yes trace only means that only the total pressure is correct ? IWAVPR:決定波函數(shù)和/或電荷密度怎樣從一個離子配置向下一個離子配置進(jìn)行推測。取值:0~3,10~13(0-無推測,1,11-用原子電荷密度進(jìn)行簡單推測,2,12-二階推測,3,13-混合前兩種方法),缺省值:ifIBRION=0(MD),1,2(relaxation) 2 else(靜態(tài)計算) 0 推測結(jié)果保存在外部文件TMPCAR中,取值+10則全部使用內(nèi)存,不保存此文件。 ? ISYM:決定是否使用對稱性。取值:-1~3(-1,0-不使用,1,2,3-使用),缺省值:if使用US-PP 1,if使用PAW 2 ISYM=2使用一種效率更高也更節(jié)省內(nèi)存的電荷密度對稱性,ISYM=3時僅考慮力和應(yīng)力張量的對稱性,而電荷密度是非對稱的。 ? SYMPREC:決定POSCAR文件中給出的位置的精度。取值:實數(shù),缺省值:10-5 ? LCORR:決定是否對非完全自洽計算中的力進(jìn)行Harris修正。取值:.TRUE./.FALSE.,缺省值:.TRUE. ? TEBEG, TEEND:控制從頭分子動力學(xué)計算中的起始溫度和最終溫度(MD有效)。取值:實數(shù),缺省值:TEBEG = 0 TEEND = TEBEG 注意VASP的溫度定義與實際溫度有細(xì)微的差別,所以TEBEG=T(N-1)/N,T為實際要求的溫度,N為原子數(shù)。 ? SMASS:控制從頭MD中的速度。取值:-3~0,缺省值:-3微正則系綜(總自由能不變),-2保持初速度不變,-1每NBLOCK步調(diào)整速度,來保證動能連續(xù),>=0 Nos算法模擬正則系綜 ? NPACO:成對相關(guān)函數(shù)的槽數(shù)。取值:整數(shù),缺省值:256 ? APACO:成對相關(guān)函數(shù)求值中的最大距離(?)。取值:整數(shù),缺省值:16 簡單說就是在不超過APACO的NPACO個距離上求成對相關(guān)函數(shù)PCF。 ? RWIGS:給出Wigner-Seitz半徑,DOS計算用。取值:實數(shù)數(shù)組,缺省值:從POTCAR文件中讀取 ? NELECT:總電子數(shù),如果系統(tǒng)不是電中性的就必須設(shè)置,所帶電荷作為均一的背景電子氣考慮。取值:實數(shù),缺省值:-(價電子數(shù)),由POSCAR和POTCAR文件自動決定(通常不必給出)。 ? NUPDOWN上下自旋成分間的電子數(shù)之差。取值:整數(shù),缺省值:未設(shè)置(此時將進(jìn)行完全弛豫) ? EMIN, EMAX:DOS求值的最小/最大能量。取值:實數(shù),缺省值:EMIN = - (lowest KS-eigenvalue -Δ),EMAX = - (highest KS-eigenvalue -Δ) ? ISMEAR:決定每個波函數(shù)的部分占位fnk如何設(shè)置。取值:-5 | -4 | -3 | -2 | 0 | N(-5-帶有Blochl修正的四面體方法, -4-不帶Blochl修正的四面體方法, -3-根據(jù)INCAR文件中提供的smearing參數(shù)執(zhí)行循環(huán),-2-從WAVECAR文件中讀取, -1-Fermi-smearing, 0-Gaussian smearing, >0-method of Methfessel-Paxton orderN,缺省值:1 采用部分占位波函數(shù),用一個函數(shù)來平滑積分,尤其是對于金屬體系可減少k點。 ? SIGMA:決定smearing的寬度(eV)。取值:實數(shù),缺省值:0.2 ? ALGO:指定電子最小化算法。取值:Normal(blocked Davidson block iteration scheme)/VeryFast(RMM-DIIS)/Fast (前兩個算法的混合)/All(波函數(shù)的所有帶同時更新)/ Damped(damped velocity friction algorithm),缺省值: Normal ? IALGO:指定主算法(整數(shù)選擇算法)。取值:8(共軛梯度算法)/38(Davidson block iteration scheme)/48(RMM-DIIS),缺省值:38 算法是最重要的參數(shù)之一。一般VASP推薦使用的是以上三種算法,一般來說8/38是初期比較快收斂,在接近平衡時采用48較快,在初期或MD時使用48可能會遇到不收斂的情況。也可以使用ALGO參數(shù)來替代IALGO,設(shè)置Fast,VASP會先用38,再自動切換到48。各種算法只要收斂,結(jié)果應(yīng)該一致。 另一個可能有用的選項是-1。不進(jìn)行實際的計算,只對重要的步驟做計算測試,并將測試得到的各部分耗時輸出到OUTPUT中。 ? VOSKOWN:決定是否使用VWN插值算法。取值:0(不使用)/1(使用),缺省值:0 如果使用了PW91泛函或需要計算磁性質(zhì)時可以設(shè)為1使用。 ? Mixing-tags: w IMIX:混合的類型,取值:整數(shù),缺省值:4 w AMIX:線性混合參數(shù)。取值:實數(shù),缺省值:0.8(US-PP),0.4(PAW) w AMIN:最小混合參數(shù)。取值:實數(shù),缺省值:0.1 w BMIX:Kerker混合方案的截斷波向量。取值:實數(shù),缺省值:1.0 w AMIX_MAG:磁化過程的線性混合參數(shù)。取值:實數(shù),缺省值:1.6 w BMIX_MAG:磁化過程的Kerker混合方案的截斷波向量。取值:實數(shù),缺省值:1.0 w WC:Broyden混合方案中每步的加權(quán)因子。取值:實數(shù),缺省值:1000.0 w INIMIX:Broyden混合方案中的初始混合類型。取值:整數(shù),缺省值:1 w MIXPRE:Broyden混合方案中的預(yù)處理類型。取值:整數(shù),缺省值:1 w MAXMIX:Broyden混合器中存儲的最大步數(shù)。取值:整數(shù),缺省值:-45 值得注意的是,在MD或者弛豫的時候,設(shè)置MAXMIX(>0,一般約3倍的電子SC步數(shù))可能會大大減少核運動步數(shù),但同時也會增加對內(nèi)存的要求。 ? LWAVE,LCHARG:決定是否把波函數(shù)(或電荷密度)寫入外部文件WAVECAR(或CHGCAR和CHG)中。取值:.TRUE./.FALSE.,缺省值:.TRUE. ? LVTOT:決定是否把總局域勢寫入外部文件LOCPOT中。取值:.TRUE./.FALSE.,缺省值:. FALSE. ? LELF:決定是否創(chuàng)建ELFCAR文件。取值:.TRUE./.FALSE.,缺省值:. FALSE. ELFCAR用于保存ELF(electron localization function)。 ? LORBIT:和適當(dāng)?shù)腞WIGS一起決定是否創(chuàng)建PROCAR或PROOUT文件。取值:0 | 1 | 2 | 5 | 10 | 11 | 12,缺省值:0(創(chuàng)建DOSCAR和PROCAR文件) ? NPAR:用于控制VASP切換到帶間并行模式。取值:整數(shù),缺省值:總節(jié)點數(shù)。 每一個節(jié)點計算一個帶,可以提高并行效率,減少通訊量,但可能會大幅增加內(nèi)存的需求。 ? NBANDS:給出計算中實際的總能帶數(shù)。取值:整數(shù),缺省值:NELECT/2+NIONS/2(非自旋),0.6*NELECT + NMAG(自旋) NBANDS的取值應(yīng)使計算中包含相當(dāng)數(shù)量的空帶。因為計算需要大量的空帶,至少要求1個空帶(否則VASP會給出警告)。 NBANDS對于解決內(nèi)存需求非常重要。一般NBANDS在NELECT/2+NIONS/2以上可以得到較為精確的結(jié)果,但如果內(nèi)存不夠就只能減少NBANDS,在犧牲精度和體系大小之間平衡了。 POTCAR文件 贗勢文件,最重要的輸入文件之一??梢岳斫鉃榉肿恿W(xué)模擬中的力場文件,但包含的信息更多。VASP將各元素優(yōu)化的INCAR里的參數(shù)也包含在該文件中,作為支持PREC的缺省選擇。 通常各元素的POTCAR文件已經(jīng)包含在VASP軟件包中的贗勢庫里了,用戶需要做的是確定自己具體需要哪幾種贗勢,然后按照POSCAR文件里的順序,將所選擇的POTCAR文件按順序連接起來就可以了。如以下命令: cat file1 file2 file3 > POTCAR 贗勢庫中的贗勢文件可以分為以下幾類: l 根據(jù)產(chǎn)生方法的不同有Ultra-soft贗勢(USPP)和投影擴充波贗勢(PAW); l 根據(jù)交換關(guān)聯(lián)函數(shù)的不同有LDA(local density approximation)和GGA(generalized gradient approximation,又可以再分為PW91和PBE); l 根據(jù)半芯態(tài)的不同元素A的贗勢文件還可以分為A,A_sv和A_pv; l 根據(jù)選取的不同截斷能量(ENMAX)元素A的贗勢文件還可以分為A,A_s和A_h。 VASP的贗勢文件放在目錄~/vasp/potentials下,該目錄又包含五個子目錄:pot,pot_GGA,potpaw,potpaw_GGA,potpaw_PBE,其中每個子目錄對應(yīng)一種贗勢形式:pot ==> PP, LDA;pot_GGA ==> PP, GGA;potpaw ==> PAW, LDA;potpaw_GGA ==> PAW, GGA, PW91;potpaw_PBE ==> PAW, GGA, PBE。每個目錄中每種元素根據(jù)截斷能量和半芯態(tài)的不同還會有多個對應(yīng)的贗勢文件存在。 在具體選取時可以參考各版本同目錄下的V_RHFIN和PSCTR文件,這兩個文件說明了該版本的贗勢是如何生成的。 選好所要使用的贗勢之后,進(jìn)入對應(yīng)的目錄,會看到里面有四個文件:POTCAR.Z,PSCTR.Z,V_RHFIN.Z和WS_FTP.LOG?,F(xiàn)在需要用到的是第一個,把各元素的該文件解壓(zcat POTCAR.Z > file),然后用cp或mv命令把這些文件移到工作目錄里,再用cat命令把它們合并到POTCAR中,就得到了我們需要的POTCAR。注意要記住這里元素的排列順序,以后在POSCAR文件中各元素的排列就是按照這個順序。 POSCAR文件 位置文件。描述所計算體系的晶胞參數(shù)、原子個數(shù)及晶胞中原子的位置,以及分子動力學(xué)計算時原子的初始速度。 POSCAR文件示例: Si-fcc 5.43 0.0 0.50 0.50 0.50 0.00 0.50 0.50 0.50 0.00 2 Direct 0.0 0.00 0.00 0.25 0.25 0.25 POSCAR文件的結(jié)構(gòu): 第1行:任意文字注釋。 第2行:晶格常數(shù)(?),也是晶矢的縮放系數(shù),后面所有長度值得自原值除以此值。a=b=c時取a即可,否則一般取三者最大值,若取負(fù)值,則為晶胞體積(?3)。 第3-5行:定義晶矢。 第6行:每種元素的原子個數(shù),特別注意順序,要與下面的坐標(biāo)順序以及POTCAR中的順序一致。 第7行:可省略,無需空行。 做動力學(xué)時,用于指定是否需要固定部分原子的坐標(biāo)。若是,此行以‘S’或者‘s’作為首字母即可。 第8行開始為原子的坐標(biāo)位置,格式為 option line coordinate1 of element1 coordinate2 of element1 ... coordinateN of element1 option line coordinate1 of element2 coordinate2 of element2 ... coordinateM of element2 ... 其中,option line指定輸入坐標(biāo)的格式,除了第一個以外,如果后面的輸入格式同前,則都可以無空行省略。 option line可指定的輸入坐標(biāo)格式有兩種: ‘D’or‘d’for direct mode ‘C’or‘c’or‘K’or‘k’for cartesian mode 顧名思義,前者是定義在三個晶矢方向上的坐標(biāo):R=R1x+ R2y +R3z,R1,R2,R3為前面的晶矢,x,y,z為輸入的三個坐標(biāo),R為原子坐標(biāo)位矢,是相對于晶矢給出的,而后者則是以笛卡爾坐標(biāo)系來給出原子的絕對坐標(biāo),實際就是將直角坐標(biāo)除以前面第二行定義的晶胞常數(shù)后得到的坐標(biāo)值。 如果第7行設(shè)定為S(Selective Dynamic),則可以用以下形式定義各坐標(biāo)是否可以移動: Selective dynamics Cartesian 0.00 0.00 0.00 T T F 0.25 0.25 0.25 F F F KPOINTS文件 設(shè)置布里淵區(qū)k點網(wǎng)格取樣大小或能帶結(jié)構(gòu)計算時沿高對稱方向的k點。 一般來說,k點越密越多,計算精度也就越高,但計算成本也會越高。因此,對于原子數(shù)較多的體系的計算,需要謹(jǐn)慎的嘗試k點數(shù)目,在避免或者預(yù)先評估wrap-around error的前提下盡量減少k點數(shù)目。 KPOINTS文件示例: k-points along high symmetry lines 11 Reciprocal 0.00 0.00 0.00 1.00 0.05 0.00 0.05 1.00 …… 0.05 0.00 0.50 1.00 KPOINTS文件結(jié)構(gòu): 第1行:注釋行。 第2行:k點總數(shù),或者‘0’(自動生成網(wǎng)格(Automatic k-mesh generation))。 如果是前者,給出k點總數(shù),又分為兩種情況: M:全手動(Entering all k-points explicitly),手動輸入即自定義各個k點的坐標(biāo)和權(quán)重,推薦只在能帶計算時使用。此時: 第3行:輸入格式標(biāo)識。直角坐標(biāo)(Cartesian)或倒易坐標(biāo)(Reciprocal)。同樣的,‘c’、‘C’、‘k’、‘K’for Cartesian,其他首字母則自動切換到Reciprocal。 第4~n行:逐個k點的坐標(biāo)描述。格式為“x y z W”。其中“x y z”是該點的三個坐標(biāo),W是權(quán)重。所有k點的權(quán)重相互之間的比例對了就行,VASP會自動歸一的。 注意C坐標(biāo)和R坐標(biāo)的定義: C:k=(2π/a)(x y z) R:k=x*b1+y*b2+z*b3(b1-b3為倒易晶矢) 這里“x y z”只是代表了坐標(biāo)的順序,與坐標(biāo)軸無關(guān)。 一般如非必要,可以先用自動模式生成k點,VASP會自動生成一個簡約化后的k點矩陣,存于IBZKPT文件,可以直接復(fù)制里面的數(shù)據(jù)到KPOINTS文件中使用,這也是該輸入法的主要用途,可以減少重復(fù)自動生成格點的時間。另一個用途是為了做精確的DOS(Density of status)計算,由于這類計算所需的k點數(shù)極大,通過全手動盡可能的優(yōu)化k點也就必需了。 L:半手動/線形模式(Line-mode):在計算能帶結(jié)構(gòu)時使用,此時需要精確地選取k點,在指定的高對稱性方向上生成指定數(shù)目的k點。此時: 第2行:指定兩點間生成的k點數(shù),不同于全自動的總k點數(shù)。 第2.5行:‘L’表示是線形模式。 第3行:輸入格式標(biāo)識,同前。 第4~n行:每行描述一個點,格式為“x y z”。每兩行的點連成一條直線,在兩點間生成指定數(shù)目的k點。每隔兩行間以空行區(qū)分,例如: k-points along high symmetry lines 10 Line-mode Reciprocal 0 0 0 0.5 0.5 0 0.5 0.5 0 0.5 0.75 0.25 最常用的方法是讓程序自動生成k點網(wǎng)格,用戶只需定義網(wǎng)格取樣大小即可。此時: 第2行:0 第3行:生成k點的方法。 “A”:全自動模式,可以看作以Г點為圓心以l為半徑做圓,當(dāng)然各晶矢不同時,相應(yīng)的圓就被拉成了橢圓,以確保三個倒格晶矢方向上覆蓋的k點數(shù)都為l “G”:Г/Gamma方法 “M”:Monkhorst-Pack方法 其它首字母:高級模式,就是用C坐標(biāo)或R坐標(biāo)直接輸入新的晶矢,一般不使用 第4行:在各個晶矢方向上分割各晶矢的點數(shù)。一般為奇數(shù),使得產(chǎn)生的k點是以Gamma點為中心的。 第5行:是否移動網(wǎng)格點以及移動多少,也即偏移原點的位矢,一般設(shè)成“0 0 0”,表示不移動。 例如: Automatic generation 0 Monhkorst-Pack 9 9 9 0.0 0.0 0.0 VASP的輸出文件主要包括: l OUTCAR:包含運行VASP作業(yè)后得到的絕大部分計算結(jié)果以及每步迭代的詳細(xì)情況; l CHG, CHGCAR:給出體系的電荷密度。兩個文件內(nèi)容相同,但前者的數(shù)據(jù)精度比后者略低一些; l DOSCAR, EIGENVAL:分別給出所計算體系的電子態(tài)密度和本征值。兩個文件中的能量值都是絕對的; l WAVECAR:給出所計算體系的電子波函數(shù),二進(jìn)制文件,不可編輯; l OSZICAR:包含每次迭代或離子移動情況的簡單匯總; l CONTCAR:給出離子進(jìn)行弛豫時,每次移動后體系的晶格參數(shù),與POSCAR內(nèi)容相同; l PCDAT, XDATCAR:給出有關(guān)分子動力學(xué)模擬中的一些結(jié)果,如配對相關(guān)函數(shù); 0人 | 分享到: 閱讀(197)|評論(0)|引用(0)|舉報- 1.請仔細(xì)閱讀文檔,確保文檔完整性,對于不預(yù)覽、不比對內(nèi)容而直接下載帶來的問題本站不予受理。
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