《蛋白質(zhì)的生物合成》PPT課件.ppt
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第十章蛋白質(zhì)的生物合成,●蛋白質(zhì)合成體系●蛋白質(zhì)的生物合成過(guò)程●蛋白質(zhì)合成后的加工●蛋白質(zhì)的定向轉(zhuǎn)運(yùn),●翻譯(translation):以mRNA為模板合成蛋白質(zhì)的過(guò)程,稱(chēng)為翻譯?!窕虮磉_(dá)(geneexpression):是指細(xì)胞在生命過(guò)程中,把儲(chǔ)存在DNA順序中遺傳信息經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)錄和翻譯,轉(zhuǎn)變成具有生物活性的蛋白質(zhì)分子。,一、蛋白質(zhì)合成體系,●參與蛋白質(zhì)生物合成的各種因素構(gòu)成了蛋白質(zhì)合成體系,該體系包括:①mRNA:作為蛋白質(zhì)生物合成的模板,決定多肽鏈中氨基酸的排列順序;②核糖體:蛋白質(zhì)生物合成的場(chǎng)所;,③tRNA:搬運(yùn)氨基酸的工具;④起始因子(IF);⑤延長(zhǎng)因子(EF);⑥釋放因子(RF);⑦氨酰-tRNA合成酶;⑧供能物質(zhì)及無(wú)機(jī)離子,等等。,(一)mRNA與遺傳密碼●密碼子(codon):作為指導(dǎo)蛋白質(zhì)生物合成的模板,mRNA中每三個(gè)相鄰的核苷酸組成三聯(lián)體,代表一個(gè)氨基酸的信息,此三聯(lián)體就稱(chēng)為密碼子(codon)。,●遺傳密碼的破譯1961年Nirenberg建立了無(wú)細(xì)胞系統(tǒng),這一新技術(shù)又是在多核苷酸磷酸化酶發(fā)現(xiàn)的基礎(chǔ)上建立起來(lái)的。,(1)去模板:用DNAase處理E.coli抽提物,使DNA降解,除去原有的細(xì)菌模板。(2)加入polyU:合成了多聚苯丙氨酸,這一結(jié)果不僅證實(shí)了無(wú)細(xì)胞系統(tǒng)的成功,同時(shí)還表明UUU是苯丙氨酸的密碼子。分別加入polyA和polyC結(jié)果相應(yīng)地獲得了多聚賴(lài)氨酸和多聚脯氨酸。,*用于蛋白質(zhì)的生物合成研究的體外翻譯系統(tǒng)主要有:細(xì)菌(大腸桿菌)無(wú)細(xì)胞系統(tǒng)、網(wǎng)織紅細(xì)胞裂解系統(tǒng)和麥胚系統(tǒng)等。,●遺傳密碼的特點(diǎn):①無(wú)標(biāo)點(diǎn)、不重疊(連續(xù)性);②簡(jiǎn)并性;③通用性(但在線(xiàn)粒體或葉綠體中特殊);④方向性,即解讀方向?yàn)?′→3′;⑤擺動(dòng)性;⑥起始密碼:AUG;終止密碼:UAA、UAG、UGA。,*開(kāi)放閱讀框架(openreadingframe,ORF):從mRNA5?端起始密碼子AUG到3?端終止密碼子之間的核苷酸序列,各個(gè)三聯(lián)體密碼連續(xù)排列編碼一個(gè)蛋白質(zhì)多肽鏈,稱(chēng)為~。,*移碼突變(frameshiftmutation):基因損傷引起mRNA閱讀框架內(nèi)的堿基發(fā)生插入或缺失,可能導(dǎo)致。,*簡(jiǎn)并性:同一種氨基酸有兩個(gè)或更多密碼子的現(xiàn)象。*同義密碼子:對(duì)應(yīng)于同一氨基酸的不同密碼子。*擺動(dòng)性:轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸的tRNA上的反密碼子需要通過(guò)堿基互補(bǔ)與mRNA上的遺傳密碼子反向配對(duì)結(jié)合,在密碼子與反密碼子的配對(duì)中,前兩對(duì)嚴(yán)格遵守堿基配對(duì)原則,第三對(duì)堿基有一定的自由度,可以“擺動(dòng)”,這種現(xiàn)象稱(chēng)為密碼子的擺動(dòng)性。,U,擺動(dòng)配對(duì),密碼子、反密碼子配對(duì)的擺動(dòng)現(xiàn)象,(二)rRNA和核糖體,rRNA(55%)和蛋白質(zhì)(45%)組成了核糖體。核糖體由大、小不同的兩個(gè)亞基組成。原核生物和真核生物的核糖體組成及特性不相同。,●核糖體的組成,表14-7原核和真核生物核糖體的組成及功能核糖體亞基rRNAs蛋白R(shí)NA的特異順序和功能細(xì)菌70S50S23S=2904b31種(L1-L31)含CGAAC和GTψCG互補(bǔ)2.5106D5S=120b66%RNA30S16S=1542b21種(S1-S21)16SrRNA(CCUCCU)和S-D順序(AGGAGG)互補(bǔ)哺乳動(dòng)物80S60S28S=4718b49種有GAUC和tRNAfMat的TψCG互補(bǔ)4.2106D5S=120b60%RNA5.8S=160b40S18S=1874b33種和Capm7G結(jié)合,,,,,,,,●核糖體的功能:合成蛋白質(zhì)的場(chǎng)所。,核糖體小亞基負(fù)責(zé)對(duì)模板mRNA進(jìn)行序列特異性識(shí)別,如起始部分的識(shí)別、密碼子與反密碼子的相互作用等。核糖體大亞基負(fù)責(zé)攜帶氨基酸及tRNA的功能,包括肽鍵的形成、AA-tRNA、肽酰-tRNA的結(jié)合等。,在單個(gè)核糖體上,可劃分多個(gè)功能活性中心,在蛋白質(zhì)合成過(guò)程中各有專(zhuān)一的識(shí)別作用和功能?!駇RNA結(jié)合部位——小亞基●結(jié)合或接受AA-tRNA部位(A位)——大亞基●結(jié)合或接受肽酰-tRNA的部位(P位)——大亞基●肽基轉(zhuǎn)移部位——大亞基●形成肽鍵的部位(轉(zhuǎn)肽酶中心)——大亞基,二、蛋白質(zhì)的合成過(guò)程1、氨基酸的活化及轉(zhuǎn)運(yùn),氨基酰-tRNA合成酶對(duì)底物氨基酸和tRNA都有高度特異性。氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreadingactivity)。氨基酰-tRNA的表示方法:Ala-tRNAAlaSer-tRNASerMet-tRNAMet,原核生物中,起始氨基酸是:起始AA-tRNA是:真核生物中,起始氨基酸是:起始AA-tRNA是:,甲酰甲硫氨酸fMet-tRNAfMet甲硫氨酸Met-tRNAMet,第一步反應(yīng),氨基酸+ATP-E—→氨基酰-AMP-E+AMP+PPi,第二步反應(yīng),氨基酰-AMP-E+tRNA↓氨基酰-tRNA+AMP+E,2、翻譯的起始,原核生物(以細(xì)菌為例)翻譯的起始所需成分:30S小亞基、50S大亞基、模板mRNA、fMet-tRNAfMet、GTP、Mg2+翻譯起始因子:IF-1、IF-2、IF-3、,IF-3,IF-1,翻譯起始(翻譯起始復(fù)合物形成)又可被分成3步:(1)30s小亞基首先與翻譯起始因子IF-1、IF-3結(jié)合,通過(guò)SD序列與mRNA模板相結(jié)合。,S-D序列,S-D序列:存在于原核生物起始密碼子AUG上游7~12個(gè)核苷酸處的一種4~7個(gè)核苷酸的保守片段(AGGAGGU),它與16SrRNA3,端反向互補(bǔ),所以可將mRNA的AUG起始密碼子置于核糖體的適當(dāng)位置以便起始翻譯作用。,IF-3,IF-1,(2)在IF-2和GTP的幫助下,fMet-tRNAfMet進(jìn)入小亞基的P位,tRNA上的反密碼子與mRNA上的起始密碼子配對(duì)。,IF-3,IF-1,IF-2,,GTP,(3)帶有tRNA、mRNA和3個(gè)翻譯起始因子的小亞基復(fù)合物與50S大亞基結(jié)合,GTP水解,釋放翻譯起始因子。,,真核生物翻譯起始復(fù)合物形成過(guò)程,肽鏈延伸由許多循環(huán)組成,每加一個(gè)氨基酸就是一個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)包括:進(jìn)位、轉(zhuǎn)肽和移位。延伸因子(elongationfactor,EF):原核生物:EF-T(EF-Tu,EF-Ts)EF-G真核生物:EF-1、EF-2,3、肽鏈的延伸,(1)進(jìn)位:AA-tRNA與核糖體A位點(diǎn)的結(jié)合,需要消耗GTP,并需EF-Tu、EF-Ts兩種延伸因子,通過(guò)延伸因子EF-Ts再生GTP,形成EF-Tu?GTP復(fù)合物,EF-Tu-GDP+EF-TsEF-Tu-Ts+GDPEF-Tu-Ts+GTPEF-Tu-GTP+EF-Ts,,,,重新參與下一輪循環(huán),(2)轉(zhuǎn)肽是由轉(zhuǎn)肽酶/肽基轉(zhuǎn)移酶催化,(3)移位,核糖體向mRNA3’端方向移動(dòng)一個(gè)密碼子。需要消耗GTP,并需EF-G延伸因子,延長(zhǎng)因子EF-G有轉(zhuǎn)位酶(translocase)活性,可結(jié)合并水解1分子GTP,促進(jìn)核蛋白體向mRNA的3側(cè)移動(dòng)。,原核肽鏈合成終止過(guò)程,4、肽鏈的終止,,▲真核生物只有一個(gè)終止因子(eRF)。,三、蛋白質(zhì)合成后的加工,1、一級(jí)結(jié)構(gòu)的加工修飾(1)N端甲酰蛋氨酸或蛋氨酸的切除:N端的甲酰蛋氨酸,必須在多肽鏈折疊成一定的空間結(jié)構(gòu)之前被切除(在真核生物中,N端的蛋氨酸常在肽鏈的其他部分還未完全合成時(shí)就已經(jīng)水解下來(lái))。,(2)氨基酸的修飾:由專(zhuān)一性的酶催化進(jìn)行修飾,包括糖基化(某些蛋白分子中的Asp、Ser、Thr的側(cè)鏈基團(tuán)與糖基結(jié)合)、羥基化(膠原中Pro、Lys的羥基化)、磷酸化(某些蛋白質(zhì)中的Ser、Thr、Tyr殘基中的-OH磷酸化)、甲?;?。(3)二硫鍵的形成:由專(zhuān)一性的氧化酶催化,將-SH氧化為-S-S-。(4)肽段的切除:某些多肽鏈要在專(zhuān)一性的蛋白酶水解切除部分肽段后,才能轉(zhuǎn)變成有功能的蛋白質(zhì)。,2、高級(jí)結(jié)構(gòu)的形成(1)構(gòu)象的形成;生物體內(nèi)多肽鏈的準(zhǔn)確折疊和組裝需要某些輔助蛋白質(zhì)參與,其本身不參與終產(chǎn)物的形成,這種輔助蛋白質(zhì)稱(chēng)為分子伴侶或監(jiān)護(hù)蛋白。(2)亞基的聚合;(3)輔基的連接。,四、蛋白質(zhì)的定向轉(zhuǎn)運(yùn),□幾類(lèi)主要蛋白質(zhì)的運(yùn)轉(zhuǎn)機(jī)制,●翻譯-運(yùn)轉(zhuǎn)同步機(jī)制,◇信號(hào)肽假說(shuō):共翻譯定位蛋白質(zhì)定位信息存在于該蛋白質(zhì)自身結(jié)構(gòu)中(信號(hào)肽),并可通過(guò)與特殊受體相互作用,使蛋白質(zhì)定位于靶位。絕大部分被運(yùn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)腔蛋白質(zhì)都帶有一個(gè)信號(hào)肽。信號(hào)肽(signalpeptide):某種分泌蛋白質(zhì)及細(xì)胞膜蛋白質(zhì)等,以前體物質(zhì)多肽的形式合成,其N(xiāo)末端含有作為通過(guò)膜時(shí)之信號(hào)的氨基酸序列,這種氨基酸序列稱(chēng)信號(hào)肽或信號(hào)序列(signalsequence)。由約15—30個(gè)氨基酸所組成。,◇信號(hào)肽結(jié)構(gòu)特點(diǎn):(1)常位于蛋白質(zhì)N末端,可切割;(2)長(zhǎng)度:15-30個(gè)殘基;(3)序列內(nèi)有一個(gè)全部或大部分疏水組成的疏水核心;(4)靠近該序列N端常有1個(gè)或數(shù)個(gè)正電荷氨基酸;(5)其C-末端靠近切割處常帶數(shù)個(gè)極性氨基酸,離切割點(diǎn)最近那個(gè)氨基酸常帶很短側(cè)鏈(Ala或Gly),,新生蛋白質(zhì)通過(guò)同步轉(zhuǎn)運(yùn)途徑進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)腔的主要過(guò)程,作業(yè)題,一、名詞解釋翻譯密碼子開(kāi)放閱讀框架(ORF)SD序列分子伴侶信號(hào)肽糖酵解β-氧化作用三羧酸循環(huán)尿素循環(huán)呼吸鏈PCR技術(shù)半保留復(fù)制二、問(wèn)答題教材P411:第2、4、5和9題。,- 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