2.第二章 菌物的分類

一、菌物在自然界的地位一、菌物在自然界的地位 林奈林奈(Linnaeus)(Linnaeus),1753-201753-20世紀(jì)世紀(jì)5050年代，年代，兩界系統(tǒng)兩界系統(tǒng)：植物界植物界(真菌、黏菌及細(xì)菌真菌、黏菌及細(xì)菌)和和動(dòng)物界動(dòng)物界。Hogg Hogg 和和HaeckelHaeckel,1861-1866,1861-1866年，年，三界系統(tǒng)三界系統(tǒng)：植物界、植物界、動(dòng)物界和動(dòng)物界和原生生物界原生生物界（所有單細(xì)胞生物、藻類、原生動(dòng)（所有單細(xì)胞生物、藻類、原生動(dòng)物和真菌，細(xì)菌和藍(lán)藻另立為物和真菌，細(xì)菌和藍(lán)藻另立為“無核類無核類”）。）。CopelandCopeland,1938-1956,1938-1956年，年，四界系統(tǒng)四界系統(tǒng)：植物界、動(dòng)物植物界、動(dòng)物界、原生生物界界、原生生物界和和菌界菌界?！盁o核類無核類”被單獨(dú)為菌界被單獨(dú)為菌界。WhittakerWhittaker,1969,1969年，年，五界系統(tǒng)五界系統(tǒng)：正式把真菌（菌物）：正式把真菌（菌物）獨(dú)立成界，形成了一個(gè)較完整的縱橫統(tǒng)一的系統(tǒng)。獨(dú)立成界，形成了一個(gè)較完整的縱橫統(tǒng)一的系統(tǒng)。第二節(jié)第二節(jié) 菌物的分類菌物的分類五界系統(tǒng)五界系統(tǒng)植物界植物界動(dòng)物界動(dòng)物界原生生物界原生生物界真菌界真菌界原核生物界原核生物界真核生物真核生物原核單細(xì)胞生物原核單細(xì)胞生物無細(xì)胞生物無細(xì)胞生物 卡瓦尼史密斯卡瓦尼史密斯Cavaliver-SmithCavaliver-Smith，1988-1989年，年，八八界系統(tǒng)界系統(tǒng)（今年來由于（今年來由于分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展，分類學(xué)家們將分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展，分類學(xué)家們將rRNA的堿的堿基序列用于系統(tǒng)發(fā)育的分析中）基序列用于系統(tǒng)發(fā)育的分析中）細(xì)菌總界細(xì)菌總界（Empire BacteriaEmpire Bacteria）（1 1）真細(xì)菌界真細(xì)菌界（EubacteriaEubacteria）（2 2）古細(xì)菌界古細(xì)菌界（ArchaebacteriaArchaebacteria）真核總界真核總界（Empire EukaryotaEmpire Eukaryota）（3 3）原始動(dòng)物界原始動(dòng)物界（ArchezoaArchezoa）（4 4）原生動(dòng)物界原生動(dòng)物界（ProtozoaProtozoa）黏菌、根腫菌）黏菌、根腫菌（5 5）植物界植物界（PlantaePlantae）（6 6）動(dòng)物界動(dòng)物界（AnimaliaAnimalia）（7 7）真菌界真菌界（FungiFungi）狹義真菌）狹義真菌（8 8）假菌界假菌界（ChromistaChromista）卵菌卵菌菌物菌物（藻物界）（藻物界）獨(dú)立成界獨(dú)立成界原生生物界原生生物界 從八界分類系統(tǒng)可見從八界分類系統(tǒng)可見：所謂真菌實(shí)際上是一個(gè)所謂真菌實(shí)際上是一個(gè)由不同祖先的后裔組成的若由不同祖先的后裔組成的若干生物界的混合體，亦即多干生物界的混合體，亦即多元的元的復(fù)系類群復(fù)系類群(Polyphyletic g r o u p),并并 非 單 系 群非 單 系 群(Monophyletic group)。這。這個(gè)混雜的生物類群，過去叫個(gè)混雜的生物類群，過去叫真菌界。為了將這個(gè)舊真菌真菌界。為了將這個(gè)舊真菌界與現(xiàn)在的新真菌界（也叫界與現(xiàn)在的新真菌界（也叫真真菌）區(qū)分開，現(xiàn)在將過真真菌）區(qū)分開，現(xiàn)在將過去這個(gè)混雜的生物類群（舊去這個(gè)混雜的生物類群（舊真菌界）稱為菌物。因此菌真菌界）稱為菌物。因此菌物包括粘菌、卵菌和真菌，物包括粘菌、卵菌和真菌，分別被列入原生動(dòng)物界、假分別被列入原生動(dòng)物界、假菌界和真菌界。菌界和真菌界。原生動(dòng)物界（黏菌）假菌界（卵菌）真菌界（真菌）細(xì)胞壁細(xì)胞壁營養(yǎng)階段無細(xì)胞壁 纖維素 幾丁質(zhì)及-葡聚糖線粒體的線粒體的嵴嵴管狀管狀平坦賴氨酸合賴氨酸合成途徑成途徑二氨基庚二酸(DAP)二氨基庚二酸(DAP)-氨基已二酸(AAA)原生動(dòng)物界、假菌界和真菌界的異同原生動(dòng)物界、假菌界和真菌界的異同二、菌物的分類系統(tǒng)二、菌物的分類系統(tǒng) 菌物分類的目的菌物分類的目的：根據(jù)國際上已經(jīng)承認(rèn)的一些分類系統(tǒng)，給根據(jù)國際上已經(jīng)承認(rèn)的一些分類系統(tǒng)，給每一種菌物命名，以便相互交流有關(guān)菌物每一種菌物命名，以便相互交流有關(guān)菌物方面的資料；方面的資料；盡可能地指出已知菌種之間的親緣關(guān)系。盡可能地指出已知菌種之間的親緣關(guān)系。因?yàn)橛H緣關(guān)系相近的種，其生物學(xué)特性是因?yàn)橛H緣關(guān)系相近的種，其生物學(xué)特性是相似的。相似的。菌物分類系統(tǒng)菌物分類系統(tǒng) 由菌物學(xué)家根據(jù)相關(guān)類群菌物的形態(tài)、生理、由菌物學(xué)家根據(jù)相關(guān)類群菌物的形態(tài)、生理、生化、遺傳、生態(tài)、超微結(jié)構(gòu)及分子生物學(xué)等方面生化、遺傳、生態(tài)、超微結(jié)構(gòu)及分子生物學(xué)等方面的特征進(jìn)行歸類建立起來的。的特征進(jìn)行歸類建立起來的。目前應(yīng)用最廣的個(gè)系統(tǒng)：目前應(yīng)用最廣的個(gè)系統(tǒng)：以英國出版的以英國出版的菌物詞典菌物詞典為代表的為代表的Ainsworth 系系統(tǒng)統(tǒng)以 美 國 出 版 的以 美 國 出 版 的 菌 物 學(xué) 概 論菌 物 學(xué) 概 論 為 代 表 的為 代 表 的Alexopoulos系統(tǒng)系統(tǒng) 我國目前使用最廣的是我國目前使用最廣的是Ainsworth在在菌物詞典菌物詞典第版（第版（1971）和）和真菌進(jìn)展論文集真菌進(jìn)展論文集（1973）中）中闡述的分類系統(tǒng)。即采用闡述的分類系統(tǒng)。即采用Whitaker(1969)的生物五界的生物五界系統(tǒng)：系統(tǒng)：真菌（菌物）界包括粘菌門和真菌門，而真真菌（菌物）界包括粘菌門和真菌門，而真菌門包括菌門包括5個(gè)亞門：個(gè)亞門：鞭毛菌亞門鞭毛菌亞門（Mastigomycotina）接合菌亞門接合菌亞門（Zygomycotina）子囊菌亞門子囊菌亞門（Ascomycotina）擔(dān)子菌亞門擔(dān)子菌亞門（Basidiomycotina）半知菌亞門半知菌亞門（Deuteromycotina）真菌真菌5 5個(gè)亞門的主要特征個(gè)亞門的主要特征亞 門營 養(yǎng) 體無性繁殖有性生殖鞭毛菌原質(zhì)團(tuán)或沒有隔膜的菌絲體 游動(dòng)孢子休眠孢子囊或卵孢子接合菌菌絲體，典型的沒有隔膜 孢囊孢子接合孢子子囊菌有隔膜的菌絲體，少數(shù)是單細(xì)胞分生孢子等子囊孢子擔(dān)子菌有隔膜的菌絲體不發(fā)達(dá)擔(dān)孢子半知菌有隔膜的菌絲體或單細(xì)胞 分生孢子等沒有有性生殖，但可能進(jìn)行準(zhǔn)性生殖三、菌物的分類方法三、菌物的分類方法1.分類單元分類單元此外還有：變種、專化型、生理小種、生物型此外還有：變種、?；?、生理小種、生物型等等1 1）種種（Species）：）：是菌物分類的基本單元，是菌物分類的基本單元，多采用生物學(xué)種的概念多采用生物學(xué)種的概念，即以形態(tài)特征為基礎(chǔ)，種即以形態(tài)特征為基礎(chǔ)，種與種之間在主要形態(tài)上應(yīng)該具有顯著而穩(wěn)定的差異。與種之間在主要形態(tài)上應(yīng)該具有顯著而穩(wěn)定的差異。但有些菌物種的建立，有時(shí)還應(yīng)輔助以生態(tài)、生理、但有些菌物種的建立，有時(shí)還應(yīng)輔助以生態(tài)、生理、生化及遺傳等方面的差異。對(duì)于某些寄生性菌物，有生化及遺傳等方面的差異。對(duì)于某些寄生性菌物，有時(shí)也根據(jù)寄主范圍的不同而分為不同的種。時(shí)也根據(jù)寄主范圍的不同而分為不同的種。近年，分近年，分子生物學(xué)技術(shù)應(yīng)用于菌物學(xué)分類，出現(xiàn)了根據(jù)子生物學(xué)技術(shù)應(yīng)用于菌物學(xué)分類，出現(xiàn)了根據(jù)DNADNA序列序列同源性來劃分的系統(tǒng)發(fā)育種的概念（同源性來劃分的系統(tǒng)發(fā)育種的概念（Phylogenetic Phylogenetic speciesspecies）。）。2）變種變種(Variety，Var.)、亞種亞種(Subspecies，subsp.)：種下：種下具有一定的形態(tài)差異。具有一定的形態(tài)差異。3）?；蛯；?Forma specialis，f.sp.)：根據(jù)植物病原菌物種對(duì)：根據(jù)植物病原菌物種對(duì)不同科、屬的寄主植物的寄生?；?，在種的下面劃分為不同科、屬的寄主植物的寄生?；裕诜N的下面劃分為?；?。?；汀＃ㄈ绾瘫P菌可根據(jù)寄生麥類情況劃分為（如禾柄銹菌可根據(jù)寄生麥類情況劃分為6個(gè)?；汀Ｎ：€(gè)?；?。危害小麥的是其中一個(gè)?；停盒←湹氖瞧渲幸粋€(gè)?；停篜uccinia graminis f.sp.tritici）。）。4）小種小種(Race)、生理小種生理小種(Physiological race)：根據(jù)對(duì)不：根據(jù)對(duì)不同種或品種（一般是一套鑒別寄主品種）的致病能力差異同種或品種（一般是一套鑒別寄主品種）的致病能力差異而劃分的生物類群。而劃分的生物類群。5）生物型生物型(Biotype)：在遺傳上完全一致的個(gè)體叫生物型。：在遺傳上完全一致的個(gè)體叫生物型。6）營養(yǎng)體親和群營養(yǎng)體親和群(Vegetative compatibility group,VCG)、菌絲融合群菌絲融合群（Anastomosis group,AG）:根據(jù)營養(yǎng)體親和根據(jù)營養(yǎng)體親和性在種下或?qū)；拖旅鎰澐值念惾?，這些真菌通常不產(chǎn)生性在種下或?qū)；拖旅鎰澐值念惾海@些真菌通常不產(chǎn)生孢子。孢子。根據(jù)根據(jù)國際植物命名法規(guī)國際植物命名法規(guī)；命名起點(diǎn)命名起點(diǎn)：國際植物命名法規(guī)國際植物命名法規(guī)（1981）真菌和）真菌和植物的命名起點(diǎn)都是植物的命名起點(diǎn)都是 1753年年5月月1日。日。合格發(fā)表合格發(fā)表：有拉丁文描述；清晰的照片或繪圖；發(fā)：有拉丁文描述；清晰的照片或繪圖；發(fā)表在正式的刊物上；必需保存模式標(biāo)本（表在正式的刊物上；必需保存模式標(biāo)本（Type）。）。優(yōu)先權(quán)優(yōu)先權(quán)：第一個(gè)發(fā)表的具有優(yōu)先權(quán)，其它以后發(fā)表：第一個(gè)發(fā)表的具有優(yōu)先權(quán)，其它以后發(fā)表的名稱都是該名稱的異名（的名稱都是該名稱的異名（Synonym）。）。學(xué)名需改動(dòng)，建立新組合時(shí)，將原定名人用括號(hào)括學(xué)名需改動(dòng)，建立新組合時(shí)，將原定名人用括號(hào)括起來。起來。2.2.分類單元分類單元 屬名屬名+種名（種名（+命名人）命名人）：一種真菌只能有一個(gè)學(xué)名（有性），對(duì)于半知菌的允許一種真菌只能有一個(gè)學(xué)名（有性），對(duì)于半知菌的允許 性階段和無性階段采用不同的學(xué)名；性階段和無性階段采用不同的學(xué)名；小麥赤霉病菌：小麥赤霉病菌：Gibberella zeae（有性）（有性）Fusarium graminearum（無性）（無性）Puccinia graminis Pers.Gaeumannomyces graminis(Sacc.)Arx et/&Oliver Phytophthora parasitica Dastur var.nicotianae(Brade de Haan)Tucker（學(xué)名更改人）（學(xué)名更改人）Colletotrichum gleosporioides(Penz.)Sacc.f.sp.cuscutae 屬名的首字要大寫，種名則一律小寫，并用斜體（印刷屬名的首字要大寫，種名則一律小寫，并用斜體（印刷體）體）或下劃線（手寫）?；蛳聞澗€（手寫）。林奈林奈1753年創(chuàng)立了年創(chuàng)立了“雙名制命名法雙名制命名法”，現(xiàn)已廣泛應(yīng)用，現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于動(dòng)物、植物、菌物和細(xì)菌等各類生物。雙名制的名稱即于動(dòng)物、植物、菌物和細(xì)菌等各類生物。雙名制的名稱即生物的學(xué)名（生物的學(xué)名（Scientific name）,用拉丁名書寫。用拉丁名書寫。界（界（Kingdon）真菌界（真菌界（Fungi）門（門（Phylum）擔(dān)子菌門（擔(dān)子菌門（Basidiomycota）綱（綱（Class）冬孢菌綱（冬孢菌綱（Teliomycetes）目（目（Order）銹菌目（銹菌目（Uredinales）科（科（Family）柄銹菌科（柄銹菌科（Pucciniaceae）屬（屬（Genus）柄銹菌屬（柄銹菌屬（Puccinia）種（種（Species）禾谷種（禾谷種（Graminis）變種（變種（Variety）小麥變種（）小麥變種（Tritici）以禾柄銹菌小麥變種為例說明其分類地位：以禾柄銹菌小麥變種為例說明其分類地位：Puccinia graminis Pers.var.tritici Erikss.et.Henn.3.3.授課采用的分類系統(tǒng)授課采用的分類系統(tǒng) 基本按照基本按照菌物詞典菌物詞典第版第版(1995)(1995)和和第版第版(2001)(2001)的方法，將菌物劃分到原生動(dòng)物的方法，將菌物劃分到原生動(dòng)物界、假菌界和真菌界。并根據(jù)我國的情況單獨(dú)界、假菌界和真菌界。并根據(jù)我國的情況單獨(dú)成立半知菌類，仍按其中的三個(gè)綱（芽孢綱、成立半知菌類，仍按其中的三個(gè)綱（芽孢綱、絲孢綱和腔孢綱）講解。絲孢綱和腔孢綱）講解。菌物詞典菌物詞典第版中子囊菌不分綱直接第版中子囊菌不分綱直接分分4646目，但第版中卻分了目，但第版中卻分了8 8綱綱5656目目.為便于學(xué)為便于學(xué)習(xí)，本書仍按習(xí)，本書仍按Ainsworth(1973)Ainsworth(1973)系統(tǒng)，將子囊系統(tǒng)，將子囊菌分綱。菌分綱。原生動(dòng)物界原生動(dòng)物界 集孢黏菌門 網(wǎng)柱黏菌門 黏菌門 根腫菌門根腫菌門 根腫菌綱根腫菌綱 假菌界假菌界 絲壺菌門 網(wǎng)黏菌門 卵菌門卵菌門 卵菌綱卵菌綱 真菌界真菌界 壺菌門壺菌門 壺菌綱壺菌綱 接合菌門接合菌門 接合菌綱接合菌綱 毛菌綱子囊菌門子囊菌門半子囊菌綱半子囊菌綱不整囊菌綱核菌綱核菌綱腔菌綱腔菌綱盤菌綱盤菌綱蟲囊菌綱擔(dān)子菌門擔(dān)子菌門擔(dān)子菌綱冬孢菌綱冬孢菌綱黑粉菌綱黑粉菌綱半知菌類半知菌類芽孢綱芽孢綱絲孢綱絲孢綱腔孢綱腔孢綱第一、二節(jié)重點(diǎn)第一、二節(jié)重點(diǎn) 1.1.菌物的基本特征；菌物的基本特征；2.2.菌物營養(yǎng)體的變態(tài)和菌組織類型及其功能；菌物營養(yǎng)體的變態(tài)和菌組織類型及其功能；3.3.菌物無性繁殖和有性繁殖的方式和孢子類型；菌物無性繁殖和有性繁殖的方式和孢子類型；它們?cè)诓『Πl(fā)生發(fā)展過程中的作用如何？它們?cè)诓『Πl(fā)生發(fā)展過程中的作用如何？4.4.病原物生活史及類型；相關(guān)名詞術(shù)語的含義。病原物生活史及類型；相關(guān)名詞術(shù)語的含義。5.5.了解現(xiàn)有分類系統(tǒng)及其分類主要依據(jù)知道了解現(xiàn)有分類系統(tǒng)及其分類主要依據(jù)知道生物分八界系統(tǒng)中與菌物有關(guān)內(nèi)容分別被歸在生物分八界系統(tǒng)中與菌物有關(guān)內(nèi)容分別被歸在哪一界當(dāng)中。哪一界當(dāng)中。